本发明公开了一种融合图像的性能评估方法和系统，所述方法包括以下步骤：区域划分步骤，对各个源图像进行显著区域和非显著区域的划分；相似度计算步骤，计算所述融合图像与源图像的所述显著区域之间的结构相似度值以及所述融合图像与该源图像的非显著区域之间的结构相似度值；评价值计算步骤，根据源图像的所述显著区域的结构相似度值和所述非显著区域的结构相似度值，计算所述融合图像与该源图像之间的融合图像质量评价值FIQRO；质量评估步骤，基于所述评价计算步骤计算得出的所述各个源图像的所述融合图像质量评价值FIQRO，计算图像融合质量评估值FIFQ。本发明使评估结果能够基于人眼视觉注意机制，与人眼评价更具一致性，评估结果更为真实、准确。