本发明涉及一种深海能源基站，属于深海能源应用领域。深海电源是深海装备运行的核心动力，构建深海耐压的大型能源基站可为深海资源的探测与开发提供充足的能源动力。本发明提供一种深海能源基站，主要包括发电系统、储能系统、用电系统、应急电源、抛载系统、配重负载和浮力系统，其特征在于：所述发电系统通过水密耐压电缆将电能存储于储能系统，储能系统通过水密耐压电缆连接于抛载控制器系统和固定式用电系统，能源管理系统通过水密耐压电缆与发电系统、储能系统、应急电源进行通讯与控制。本发明还提供一种深海能源基站的运行方法，保障深海能源基站的可靠运行与控制。