本发明公开提供船舶电磁特性测试系统及方法，该系统包括船舶平台仿真模块、辐射天线和散射体建模模块、船舶平台仿真模型边界条件模块、扫频模块、电磁特性计算模块，所述船舶平台仿真模块的输出端与所述辐射天线和散射体建模模块的输入端相连接，所述辐射天线和散射体建模模块的输出端与所述船舶平台仿真模型边界条件模块的输入端相连接，所述船舶平台仿真模型边界条件模块的输出端与所述扫频模块的输入端相连接，所述扫频模块的输出端与所述电磁特性计算模块的输入端相连接。本发明可以实现对不同辐射天线的电磁波对船舶平台散射体设备干扰的仿真估计，从而为船舶平台上辐射天线的设计、安装提供理论依据。