本发明公开了一种船舶含油污水集中处理方法，将船舶废水输送到破乳池，加入破乳剂，在一定的温度下进行破乳反应，去除浮油；然后送入溶气气浮机，溶气气浮机在水中产生大量的微细气泡，将废水中未分离干净的分散油滴吸附，上浮至睡眠进一步实现油水分离；废水再依次进入兼氧池、IC厌氧塔、好氧池和曝气生物滤池进行生化处理，最后再经过超滤系统和纳滤系统处理，水质达标，实现回用。“兼氧池+IC厌氧塔+好氧池+曝气生物滤池”组成的生化系统，对废水中有机物的去除率在82％以上，远远高于传统的生化系统，同时工艺实现废水零排放。