本发明涉及一种无人船气象航线动态优化方法和系统，该方法包括：对船舶航行区域进行网格化处理，得到多个格点；获取船舶的初始航线，并对所述航行区域中所有网格点计算评价值；船舶按照所述初始航线航行过程中，实时将船舶当前位置的格点与所述初始航线进行对比、将实时气象数据与对应格点的气象数据进行对比；响应于航线偏离或气象数据发生变化，根据所述实时气象数据对船舶行驶格点所在列到终点之间格点的评价值进行更新，得到更新的格点评价值；根据所述更新的格点评价值确定最佳航线。本发明基于动态规划递推方程建立无人船气象航线动态优化模型，该模型对船舶航行海域网格化处理，根据实时海洋气象数据更新评价值，根据航线评价值获取最佳航线。