本发明公开了一种基于船用发动机的新型海水制淡系统，包括柴油发电机、烟气管、海水换热管道、气液分离管道、蒸汽管道、冷凝器、蓄水池、反渗透装置、各舱室管道，可再生能源发电装置、控制装置，柴油发电机外部设有缸套，缸套通过冷却水与海水进行换热蒸发。本海水淡化系统采用双热源形式，以蒸发‑反渗透‑蒸发的形式制取淡水，以可再生能源为动力驱动泵、反渗透装置、控制装置，在制取大量淡水的同时，采用太阳能、风能、波浪能等可再生能源作为能量来源，有效避免使用煤、石油等不可再生能源作为能量来源，做到了节约资源、节能减排的最大化。充分利用了船舶发动机的余热，提高了反渗透膜的使用寿命，降低了成本，做到了节能减排。