一种电解法船舶压载水管理系统的除氢方法和装置，该方法包括步骤旋流分离和三级液位控制；该装置包括密闭的罐体，在其上部设有切向的进液口，在罐体的顶部和底部分别设有氢气出口和出液口，该出液口通过加药泵与压载水主管路连接，在罐体内装有搅拌器和液位开关。在该液位开关上设有低液位、高液位和超高液位三个检测点。本发明的优点是：通过强制搅动，使进入除氢单元的电解产生的气液混合物形成旋流，在离心力的作用下，实现次氯酸溶液与氢气的分离；同时采取三个液位的控制方式，实现加药和除氢过程；通过鼓风机稀释分离出来的氢气，并排放至安全区域。次氯酸钠溶液通过加药泵加注到主管路。该装置具有体积小，除氢效率高，运行稳定的特点。