本发明公开了一种船舶压舱废水净化方法，包括如下步骤：S1.在高压电极与接地电极之间的空间形成电场；S2.高压气瓶中的高压气体经过气体流量控制阀进入电场空间，形成等离子体射流并喷出；S3.蓄液池中的待处理液体经过液体流量控制阀、过滤器、流量计后在液体处理器的作用下以喷雾的形式喷出，并且全部喷雾场均经过非平衡等离子体射流区域；S4.在非平衡等离子体射流的作用下，雾化场中液滴颗粒内所含有的目标净化物被杀灭；S5.检测口控制阀打开，检测口回流泵将净化后液体抽出、送入检测器中；S6.检测器对净化后液体进行分析。增设检测机制，进一步提高净化效果。