本发明实施例提供一种基于深度学习的船舶识别方法及系统，基于爬虫技术，从各目标网站中获取复杂背景下的船舶图像，同时获取干扰图像；对所述船舶图像进行预处理，将预处理后的船舶图像作为训练样本；对训练样本进行标注，基于标注的训练样本、干扰图像和n层GoogleNet卷积神经网络模型获得船舶识别模型；其中，所述n层GoogleNet卷积神经网络模型为预先设计；将待识别图像输入所述船舶识别模型，基于船舶识别模型的输出结果，获取待识别图像中的船舶，实现快速和准确进行船舶识别的技术效果。