本发明涉及船体开孔设备领域，特别是涉及一种高度可调的椭圆孔开孔器。高度可调的椭圆孔开孔器包括固定座、支撑在固定座上的导轨架和布置在导轨架上的旋转杆，固定座与导轨架之间设置有伸缩支撑杆，导轨架上设置有相互垂直的第一导轨和第二导轨，旋转杆上转动装配有导向装配在第一导轨上的第一导向块，定义旋转杆的轴向两端分别为内端和外端，旋转杆的内端上转动装配有导向装配在第二导轨上的第二导向块，旋转杆的外端上布置有高度可调的伸缩架，伸缩架的底部布置有气割喷嘴。通过伸缩支撑杆可以调节固定座与导轨架的高度，同时利用伸缩架可以调节气割喷嘴的高度，在保证气割喷嘴开孔的情况下使旋转杆可跨过障碍物，适用于船上的复杂环境。