一种水力测功器与船舶柴油机的连接及其调整方法，该船舶柴油机和水力测功器通过中间轴连接，包括：一、中间轴与水力测功器的连接：起吊中间轴，调整中间轴的大法兰与水力测功器的法兰在外圆周上各个方向上的偏差值一致，同心度达到0.05mm以内，旋紧连接螺栓；二、中间轴与柴油机曲轴的连接：吊起连接成一体的水力测功器和中间轴至试车台位上，在小法兰与曲轴法兰之间预留2mm以上间隙，使用调整垫铁对水力测功器的位置进行初调整，将两法兰的同心度以及裂面调整到满足裂面值≤0.05mm，偏差≤0.05mm的要求，针对中间轴和水力测功器的轴的挠度进行补偿调整；调整结束后在中间轴的小法兰与曲轴法兰之间安装摩擦片，然后紧固小法兰与曲轴法兰。本发明达到了提高精度、操作简单、安全可靠的良好效果。