本发明公开了一种核动力船舶中压交流系统的电源切换方法及系统，适用于核动力船舶中压交流系统，包括：至少两条供电母线以及至少两条受电母线，所述方法包括以下步骤：S1、检测受电母线中的失电母线，并判断失电母线为计划停电或故障失电；S2、故障失电时，根据失电母线与一正常受电母线的电压状态量的比较结果，按照预设优先级选择电源快速切换模式或同期切换模式或慢速切换模式，失电母线切换至由正常受电母线对应的供电母线进行供电。本发明采用电源快速切换、同期切换、慢速切换相结合的方法，通过对失电母线与正常受电母线电压幅值、工作频率以及相位角的比较，按照优先级选择切换方式，保证电源切换影响范围最小化。