本发明公开了一种船舶泵舱加热系统。该系统包括锅炉和与锅炉出汽阀连接的通汽管，所述通汽管上设有主进汽阀，所述主进汽阀连接有分若干分进汽阀，每一分进汽阀与一设置在泵舱内的蒸汽加热器的进汽口连接，每一蒸汽加热器的出汽口连接有一分回汽阀，所述分回汽阀与主回汽阀连接，所述主回汽阀连接有回汽管，所述回汽管与机舱热水井连接。本发明在航行状态下没有其他能耗，最大限度利用了废气锅炉的热能，取得了良好的经济效益，货泵、扫货泵及管路内货液不会结晶，从而使泵舱设备保持在良好的备用状态，泵体及机械密封等不会因货物结晶膨胀而损坏。使用后不需要放空货泵、扫货泵及管路内的货液，减轻船员工作强度，并减少了货损。