本发明提供了一种船舶废气脱硫、脱硝废液与船舶生活污水的同步处理装置与同步处理方法。装置包括悬浮区和填料区，悬浮区上部设有溢流口与填料区连通，进液口与悬浮区连通，出液口与填料区连通，悬浮区内设有搅拌器，悬浮区内壁两侧分别固定倾斜挡板，填料区从上到下依次设有陶瓷环层、活性炭层和聚乙烯多面空心球层。本发明将废气洗涤废液与船舶生活污水的混合液泵入，与悬浮区内的以硫酸盐还原菌为主的异养型活性污泥经搅拌器搅拌充分接触后，从悬浮区上部的溢流口进入填料区，依次经过各填料层，与生物膜充分接触后从填料区底部出水口排出。本发明方法不外加碳源，实现了船舶废气脱硫、脱硝废液中硫酸盐、亚硝酸盐与船舶生活污水中有机物的同步处理。