本发明公开了一种船载缆阵阻力系数测量系统及方法，用于测量拖缆、线阵、绳索等水下柔性拖曳体的切法向阻力系数，包括测量方法和一套测量装置，具体指一种安装于试验船上的带拉力和倾角传感器的试验装置，以及一套实时采集传感器及仪器数据并同步进行计算处理和显示的软件程序。本发明与现有常用的测量缆阵阻力的水池测量装置相比较，结构简单，安装方便，成本低廉且不需专门建造场地，并且能同步测量拉力和倾角，从而能进一步修正获得更为精确的流体水动力系数。有较强的工程实用价值，目前已经应用到包括JTC，3X1等军民品项目多次湖上拖曳试验，测得多条缆阵的切向和法向系数，取得理想的结果。