本发明公开了一种基于FPGA的相位生成载波解调系统，涉及光纤相位解调技术领域，该PGC解调系统使用FPGA作为信号处理器，可以提高系统的运算速率和解调速度；该PGC解调系统包括依次相连的PGC解调模块、数据缓存模块和异步通信模块，输入的待解调数据还直接输入到数据缓存模块进行存储，PGC解调模块采用改进的PGC解调算法对待解调数据进行解调，PGC解调模块中引入了去扰动单元，在去扰动单元中做相除运算将含有交流项和调制深度的信号消除，使输出项仅有相位信号的正切值，从而减少解调结果对外加载波引入的调制深度的依赖，也可以避免由光源等不稳定因素造成的解调结果不确定，从而提高系统解调的准确性和稳定性。