本发明公开了一种船用大型基座总组预装精度控制方法，该控制方法包括：将左舷分段与右舷分段总组形成第一总段；在第一总段上划出总段轴心线；在左舷分段和/或右舷分段上划出第一肋位线、第二肋位线；在第一肋位线上确定第一点，使得第一点与总段轴心线相隔第一距离，在第二肋位线上确定第二点，使得第二点与总段轴心线相隔第二距离；根据第一点和第二点划出分段轴心线；吊装基座至待安装位置；调整基座使得基座上的中心洋冲点与分段轴心线重合、基座的表面高度与所述第一点或者第二点等于预定高度。本发明的有益效果为可以有效的释放吊车资源，提升搭载的控制精度及效率，缩短船舶建造坞期，节约成本，具有较高的实用性。