本发明涉及一种高速大惯量负载用无铁芯无刷直流电机控制系统及方法，其技术特点在于：包括无铁芯无刷直流电机、控制系统及其内部的驱动电路；所述控制系统包括信号检测模块、数字控制模块和线性功率驱动模块；所述内部的驱动电路包括：直流电源、电源滤波模块、三相逆变桥、梯形波反电动势无刷直流电机、三相电感、电流检测模块和数字控制器。本发明能够为高速大惯量飞轮用的无铁芯无刷直流电机的控制提供一种减小启动电流，减小电流换相波动的控制系统，并使大惯量系统能够稳定高速运转。