本发明公开了一种船用生活污水的深度处理装置，其特点是该深度处理装置由缓冲槽、生物活性炭柱、紫外消毒器和清水槽组成，缓冲槽由气液混合泵通过管道与生物活性炭柱底部的进水管连接，其顶部的出水管通过紫外消毒器与清水槽连接；所述清水槽设有排水泵，其出口分别与向活性炭滤层进行反冲洗的冲洗管，以及排出装置的出水管连接。本发明与现有技术相比具有结构紧凑，设备体积小，节约了船舶内部空间，同时操作简单易行，满足IMO最新船舶生活污水排放标准中对总氮去除率的要求，保证了出水水质的稳定，进而保护了海洋环境。