本发明涉及海洋防污技术领域，为克服现有自抛光防污涂层氧化亚铜防污剂使用量大、表面微结构涂层难以在船舶表面施工及因海洋微生物及无机物在表面的沉积使得涂层破坏而难起到其防污作用的问题，提供了一种表面微结构自抛光防污涂层及其制备方法，所述表面微结构自抛光防污涂层由以下重量份的组分组成：树脂20～30份，微凝胶球1～3份，交联剂1～2份，增塑剂2～3份，氧化亚铜4～5份，吡啶硫酮铜2～3份，萜烯5～8份和有机溶剂5～8份。本发明利用表面微结构和自抛光防污剂的协同防污作用，增强了涂层表面的防污效果，同时也大大降低了现有自抛光防污涂料配方防污剂的使用量，降低对海洋环境的影响。