本发明公开了一种船舶吨位自动测量方法，包括一、搭建检测系统；二、度传感器、温度传感器和超声波换能器检测船舶沿航道航行时的参数；三、控制器收到步骤二中的信息后采用最小二乘法计算船舶横截面积；四，根据步骤三中船舶的横截面积计算船舶吨位。通过设置速度传感器、温度传感器和超声波换能器阵列，自动检测船舶沿航道航行的航行速度，水温，以及超声波换能器阵列每发射一次超声波检测信号对应的时间差同样构成时间阵列，得出船舶位于水面以下的船体的宽度，采用最小二乘法计算船舶横截面积，最后得出船舶位于水面以下部分的体积。基于最小二乘法的船舶吨位计算方法，有较高的准确率，可提高船舶吨位的测量效率。