本发明公开了一种面向三维层面网格生成的层序分析方法，用于地质层面建模和地下结构分析。其特征在于，包括：对离散点构成的面片进行扫描；根据扫描的结果建立目标函数；求取使目标函数取最小值的解，并用该解作为面片的序值；利用该序值为面片分类，并将分好类的面片作为层面网格生成的数据。本发明可实现同相轴自动追踪结果的自动分类，从而完成自动化的解释，摆脱繁重的人工分类拾取，有效提高从地震数据体到层面网格建模的解释过程的效率。