本发明公开了一种空域运行仿真中冲突的自动检测和调解系统，包括：空域状态预先仿真模块，用于预测在未来一段时间内仿真空域的运行情况；冲突探测模块，用于探测某个时间点空域内飞行流的冲突情况；冲突调解模块，用于在规定允许的调解时间余量内调解已经探测到的飞行冲突；本系统实现了空域仿真运行中飞行冲突的自动检测和处理，算法简单，并可使得空域仿真更加贴近空域的实际运行情况，为空域运行的科学评估、科学规划提供辅助决策手段。