公开了一种从航空器三维位置序列提取航迹巡航段的方法，包括：（１）读取航空器气压高度数据及记录该数据的时间；（２）计算航空器当前飞行所在高度层；（３）裁掉平飞片段中的升高和降低的片段序列，得到航空器巡航段的平飞片段序列；（４）读取航空器的ＧＰＳ经纬度数据及记录该数据的时间；（５）将ＧＰＳ经纬度序列截取成直飞片段序列，裁掉转弯片段序列，得到航空器巡航段的直飞片段序列；（６）求解平飞片段序列和直飞片段序列在时间上的交集，在持续时间满足要求的序列中对采样率较低的气压高度数据进行差值，提取航迹巡航段。该方法实现了对航空器三维位置序列的分析和处理，有效地从航迹中去除爬升、下降及转弯阶段，提取航迹巡航段。