一种ＡＤＳ－Ｂ管制工作站数据处理系统包括：输入数据处理模块、单地面站跟踪模块、多地面站跟踪模块，输入数据处理模块，对输入的ＡＤＳ－Ｂ报文进行预处理，同时对错误报文发出相应的告警信息；单地面站跟踪模块，对各个单站ＡＤＳ－Ｂ报文，对其中的状态报文数据、模式报文数据、勤务报文分别进行处理，通过航迹起始建立起各个单站ＡＤＳ－Ｂ航迹，并通过航迹更新与终止维护各单站ＡＤＳ－Ｂ航迹链表；多地面站跟踪模块，用于根据目标的各个已建立的单站ＡＤＳ－Ｂ航迹跟踪多个ＡＤＳ－Ｂ地面站，进行系统容量的过载保护，通过航迹起始建立各目标的多站ＡＤＳ－Ｂ系统航迹，并通过航迹更新与航迹终止维护多站ＡＤＳ－Ｂ系统航迹链表。本发明能够针对ＡＤＳ－Ｂ处理，同时处理复杂程度降低。