一种捷联惯性导航中器件周期误差快速精确补偿方法，根据器件级数据分析结果，利用误差折算公式，实时折算出导航系统级的解算数据所含误差量并将其补偿。其中误差折算公式如下求得：取一段时间内器件级的过采样原始数据做分析，确定所测器件级原始数据中包含的显著周期性误差项的个数及其特征参数，根据推导的公式计算出误差折算公式的各个系数，代入误差折算公式。本发明充分利用了器件级原始数据包含的周期性误差项信息，又具备系统级数据处理在运算量上的优势，补偿精度高，运算量小。本发明适用于各种过采样数据的周期性误差项补偿处理，尤其适用于惯性导航系统中陀螺仪与加速度计输出数据的周期性误差项补偿处理。