本发明公开了一种采用不对称方波调制方法测量干涉式光纤陀螺本征频率，该方法通过控制模块ＦＰＧＡ控制ＤＤＳ产生不同频率下的不对称方波对Ｙ波导进行相位调制；并由信号处理模块ＤＳＰ实时解算出Ａ／Ｄ采样时间Ｔ内的累加和的差值绝对值△Ｐ↓［ｄ］，并对所述差值绝对值△Ｐ↓［ｄ］进行极小值判断，当差值绝对值△Ｐ↓［ｄ］趋近于零时，则有光纤陀螺本征频率ｆ↓［ｅ］等于调制频率ｆ↓［ｄ］。此种测量方法测得的本征频率ｆ↓［ｅ］精度高，频率跟踪调整速度快，实时性高。