本申请公开了一种电摩自动变速系统及其控制方法，其中电摩自动变速系统，包括：车速检测单元，电机，电机转速检测单元，电机输出扭矩检测单元，变速箱，变速箱主轴转速检测单元，电磁离合器，变速箱电脑，以及同时与电机、变速箱电脑、车速检测单元、电机转速检测单元、变速箱主轴转速检测单元和电机输出扭矩检测单元电路连接的电机控制器。本申请能够根据电摩车辆运行工况，自动控制变速箱升降档，保证各工况扭矩需求，同时提高行驶舒适性及整车续航里程。