本发明提供了一种新能源汽车蓄电池电量控制系统，其包括蓄电池电流采样单元，用于采集蓄电池的电流、电压数据，并通过所述微处理器实时调整充电机的充电电流或关闭DC/DC充电机；输出控制、采样单元，用于控制汽车电器负载的工作状态,采集蓄电池对整车电气负载设备的电流、电压；微处理器根据采样异常信息关断输出或以PWM方式降功率输出；温度采样单元，用于采集蓄电池的实时温度数据，并将所述实时温度数据发送至微处理器，所述微处理器根据所述实时温度数据控制冷却设备的开闭。本发明保证了电池充电和正常工作，在保证了蓄电池电量正常供给的情况下，降低了DC/DC充电机输出功率，缩短了DC/DC充电机的工作时间，提升了充电机的可靠性，避免了蓄电池因连续放电造成的亏电。