本发明一方面提供一种基于可分离式新能源客车列车组的制动系统，包括智能制动控制模块、行车制动系统、驻车制动系统；行车制动系统包括：设置于头车的制动总泵信号发射模块，分别设置于头车与后车的制动总泵、前刹电磁阀、后刹电磁阀、前刹调节电磁阀、后刹调节电磁阀、前制动回路、后制动回路；驻车制动系统包括：设置于头车的手控阀信号发射模块，分别设置于头车与后车的手控阀、驻车电磁阀、驻车调节电磁阀、差动阀；另一方面提供上述系统对应的控制方法，包括行车制动部分及驻车制动部分；通过本系统及控制方法，可实现车辆在客车列车状态和独立运行状态下提供行车制动和驻车制动的功能，增大了可分离式客车列车技术的安全性。