本发明公开了一种船舶电池动力功率管理系统，包括：船舶负载模块、船舶电源模块、电源控制模块和功率管理系统单元；船舶负载模块的电源输入端通过电源控制模块与船舶电源模块电连接；电源控制模块通过接收控制指令以控制船舶电源模块的放电功率大小对船舶负载模块的输出电流进行协调控制；功率管理系统单元通过通信线缆分别与船舶负载模块、船舶电源模块和电源控制模块相连接；本发明还公开了一种船舶电池动力功率管理控制方法；本发明通过计算得到船舶电源模块在系统无效电流热损耗值最小中的优化输出电流值，并控制船舶电源模块输出最优输出电流值，从而降低电池电力船舶系统的无效热损耗，实现提高电池动力船舶的在运营中动力电池效率。