本发明公开了一种基于深度光流和形态学方法的运动目标检测方法，包括以下步骤：(1)收集视频数据，标注样本视频，并随机分成训练集和测试集，对已经处理好的训练集和测试集在做均值计算，形成训练集均值文件和测试集均值文件，完成对训练集和测试集的预处理；(2)构建全卷积神经网络架构，由编码和解码两部分构成，利用训练集和测试集，通过自适应学习率调整算法进行训练，得到训练好的模型参数；(3)将需要进行检测的图像数据输入到训练好的全卷积神经网络中，得到对应的深度光流图；(4)运用大津阈值自适应阈值分割方法处理得到的深度光流图；(5)对阈值分割后的数据进行形态学处理，去除孤立点和缝隙，最终得到检测到的运动目标区域。