本发明提供了一种寡聚甘露糖醛酸在制备抗甲型H1N1流感病毒的药物中的应用。本发明通过实验不仅证明了寡聚甘露糖醛酸OM在体外对H1N1亚型的甲型流感病毒感染的狗肾上皮细胞具有较好的保护作用，可以有效地降低病毒的复制,其作用效果与阳性对照药利巴韦林相当。而且，OM还可以显著减少甲型H1N1流感病毒感染引起的小鼠死亡，延长生存时间。本发明提供的寡聚甘露糖醛酸OM具有水溶性好、稳定性高和安全低毒等优点，在体内外实验中都证明OM具有良好的抗甲型H1N1流感病毒活性，预示该寡聚甘露糖醛酸有开发成抗甲型流感病毒药物的前景。