本实用新型公开了一种深海多功能长期原位观测系统，包括母船、吊放单元、仪器单元、原位基座；所述母船通过绞车的铠装缆与所述吊放单元的铠装缆起吊转接件连接；所述吊放单元的吊放对接裙口能与所述仪器单元的顶部对接针对接，所述吊放单元的抓紧组件能抓取和释放仪器单元的顶部对接针，实现吊放单元对仪器单元的抓取和释放；所述仪器单元的底部滑动对接件能与所述原位基座的基座对接裙口对接，实现仪器单元为原位观测基座充电用于数据采集、存储与传输。本实用新型可通过搭载不同传感器实现深海海底不同参数长时间、原位定点连续监测作业。