本发明公开了一种多台全回转舵桨的控制系统及控制方法，属于船舶控制技术领域。控制系统包括协同控制器和与多台全回转舵桨一一对应设置的多个操作手柄，控制系统被配置为具有第一工作状态和第二工作状态，当控制系统处于第一工作状态时，协同控制器用于根据多个操作手柄中的一个操作手柄产生的控制信号同时控制多台全回转舵桨；当控制系统处于第二工作状态时，协同控制器用于根据每个操作手柄产生的控制信号分别控制对应的全回转舵桨。当全回转舵桨的数量较多时，可以将该控制系统切换至第一工作状态，只需操作一个操作手柄产生控制信号，协同控制器即可根据该控制信号控制多台全回转舵桨同步回转，极大的降低了操作的复杂度和出错率，便于操作。