本发明公开了一种深海内波对海底沉积物再悬浮量的观测系统和确定方法，观测系统包括海底观测平台、缆绳和锚泊系留配重，海底观测平台装有声学释放器、单点海流计、浊度仪、高精度温盐深仪和沉积物捕获器，缆绳上设置有主浮体与子浮体，主浮体位于缆绳中部安装有声学多普勒流速剖面仪，子浮体设置有浊度仪和高精度温盐深仪，锚泊系留配重为有方框形卡槽和固定环的重力锚。其确定方法包括：室内校正仪器，利用辅助船布放和回收观测系统，读取观测仪器数据和分析捕获悬浮物成分，确定内波对沉积物的再悬浮量。本发明可以安全、稳定的放置于深海海底，可以实现从海底到海面全水深的海洋动力环境参数观测，并可确定内波对沉积物的再悬浮量。