本发明公开了一种集装箱船货舱通风结构，其设于货舱内，货舱顶部设有舱盖；舱盖上设有进风口和出风口，其特征在于，进风口设于舱盖的中部，进风口的左侧和右侧均设有出风口；进风口连接有变频送风风机，变频送风风机连接有送风管；进风管位于进风口的下方，送风管从货舱的顶部向货舱底部竖向延伸；送风管上开设有多个送风口；出风口连接有变频抽风风机，变频抽风风机连接有抽风管；抽风管位于出风口的下方；抽风管上开设有多个抽风口；送风管位于货舱的中部；抽风管位于送风管的两侧。本发明具有通风效果好、能耗低、安装及维护简单的优点。