本发明公开了一种船舶反渗透海水淡化水质的优化方法及装置。首先，根据海水淡化出水中硼的含量，设定自来水与淡化水的流量比，并且设定控制器中的混合水总硬度、总碱度和pH值的标准参数；其次，自来水和淡化水水质仪检测的总硬度、总碱度和pH值三个指标值反馈到控制器，控制器计算淡化水矿化所需达到的总硬度、总碱度和pH目标值；控制器开启淡化水输水泵，将淡化水通入矿化装置进行矿化，通过在线检测并反馈到控制器，当检测值满足目标值时，控制器开启自来水输水泵和矿化水输水泵，并根据设定的自来水与淡化水的流量比，将矿化后的淡化水和自来水按比例输送到混合水箱。本发明可有效增加船舶用水的水量、提升和稳定用水水质、减少矿化剂使用量，保障人员健康和设备安全。