本发明提供了一种基于无线通信的水电站船闸通航船舶拖曳系统，控制服务器通过通信基站与PDA手持式操控装置和拖曳船之间进行无线通信；PDA手持式操控装置接受外部输入的无线操控命令，PDA手持式操控装置发出无线操控命令，通过与附近基站通信将无线操纵命令发送至控制服务器；控制服务器将接收到的无线操控命令编码后得到实际能被拖曳船上的控制器接收的驱动指令，并再次通过基站将驱动指令发送至拖曳船上的控制器，水下电磁吸盘固定于拖曳船上，拖曳船位于水下并可以为水下电磁吸盘供电，水下电磁吸盘通电后吸附于通航船舶底面；拖曳船接收到驱动指令后为水下电磁吸盘供电，并根据驱动命令带动通航船舶在船闸内移动。