本发明涉及船舶冷却系统技术领域，提供了一种自流式冷却系统及船舶，该自流式冷却系统包括沿冷却水流动的方向依次设置的泵体与冷却器，还包括储能模块；泵体的进水口与自流水源相连通，泵体的出水口与冷却器的进水口相连，冷却器的出水口与外界相连通；储能模块与泵体相连，用于存储电能。本发明提供的自流式冷却系统，通过设置储能模块，使得当自流流量大于冷却水需求量时，储能模块可以将多余的自流能量转化为电能，并存储起来，实现了能源的充分利用；而且，在发电的过程中，可以增加系统阻力，使得自流流量下降，直至与冷却水需求量趋于平衡，此时储能模块转化电能的功率保持恒定，实现自流流量与冷却水需求匹配，该自流式冷却系统正常工作。