本发明公开了一种抛石船自动移位控制系统，包括：若干台绞车，均匀对称固定于抛石船上；所述绞车的缆绳连接于岸上的地面锚点；每台绞车都对应安装有张力传感器，用于实时检测相应缆绳的张力；每台绞车还对应安装有编码器，用于实时检测相应缆绳的绳长；GPS定位单元，安装在抛石船上，用于采集抛石船的实时位置信息；控制器，根据每根缆绳的目标绳长控制绞车收放缆绳直至目标绳长，从而带动抛石船移动，直至到达目标位置。本发明实现了绞车的无极变速，而且保证液压绞车在负载过大时不至于损坏；而且还降低了抛石船移位控制的复杂程度，在保证控制精度的同时实现了自动化的移位控制。