本申请提供一种水域污染物应急治理设备及系统，所述设备包括承载船体、驱动装置、控制装置及污染物处理装置；控制装置及驱动装置固定安装在承载船体上，控制装置与驱动装置电性连接，以控制驱动装置带动承载船体在待治理水域中航行；承载船体内开设有液流通道，液流通道一端设置在承载船体的船头上，另一端设置在承载船体的船尾上；污染物处理装置设置在液流通道内，用于对流经液流通道的待治理水域的水体进行污染物处理。本申请通过承载船体、驱动装置、控制装置及污染物处理装置之间的配合，灵活地对待治理水域中各处水体污染物进行治理，以达到低成本、高灵活且高效率的水域污染物治理效果以及快速高效地治理突发性污染事件的效果。