本发明涉及一种基于光纤惯导的波浪补偿装置专用单环控制器，包括控制器本体、光纤惯导系统、A/D转换器模块、D/A转换器模块、接口电路、伺服电机驱动模块、电液比例阀、液压驱动模块、显示器模块、矩阵键盘、电源模块和传感器模块；所述控制器本体包括主控模块和I/O口，光纤惯导系统测量船舶姿态信息，并把测得的数据传递给主控模块，在主控模块中计算当前波浪补偿装置状态与水平位置之间的偏差，并作出响应；根据波浪补偿装置结构和执行机构的类型对应连接控制器的驱动装置，并接入相应反馈传感器，通过执行机构的驱动，实现波浪补偿。本发明的优点在于：本发明专用单环控制器，能够适用不同动力装置和控制要求的波浪补偿装置。