本发明实施例提供一种船舶中央冷却器舷外海水激励换热管振动控制方法及系统，该方法包括：获取流入船舶中央冷却器的舷外海水的流体脉动压力峰值频率；若判断获知流体脉动压力峰值频率与换热管的结构固有频率之间的第一频率差值小于第一频率差值阈值，或者，流体脉动压力峰值频率与换热管外舱内冷却水激励的主要频率之间的第二频率差值小于第二频率差值阈值，则根据换热管的结构固有频率和换热管外舱内冷却水激励的主要频率调整舷外海水的长链聚合物浓度。本发明实施例减弱了中央冷却器舷外海水激励引起的换热管振动响应、提高中央冷却器的安全可靠性和使用寿命，且不会受限于冷却器的结构设计，能够满足多工况条件下的振动控制需求。