本发明涉及一种船舶用可再生能源混合动力系统。包括太阳能光伏电池、燃料电池、蓄电池、超级电容、质子交换膜水电解器、直流/交流逆变器和永磁同步电动机；所述太阳能光伏电池连接质子交换膜水电解器，所述太阳能光伏电池、燃料电池还分别经第一单向升压型变换器、第二单向升压型变换器接入直流母线，所述蓄电池、超级电容分别经第一双向升降压型变换器、第二双向升降压型变换器接入直流母线，所述直流母线经直流/交流逆变器与永磁同步电动机相连，以带动船舶正常工作；还包括一控制器，以控制整个系统的工作模式。本发明采用可再生能源混合动力，摆脱了对传统化石能源的依赖，为船舶航行提供了完整的可再生能源的混合供能方案。