本实用新型公开了一种用于科考船的动力系统配置，包括第一柴油发动机和第二柴油发动机，且第一柴油发动机的功率大于第二柴油发动机的功率，第一柴油发动机和第二柴油发动机的飞轮端各通过一个联轴器连接到内置离合器的两进一出的推进齿轮箱，通过推进齿轮箱的离合器切换，由第一柴油发动机或第二柴油发动机带动推进齿轮箱转动；所述推进齿轮箱的输出端与传动轴装置的输入端连接，传动轴装置的输出端与可调螺距螺旋桨装置连接。本实用新型采用的动力配置方案，使科考船在各工况下的主机负荷及利用率均达到合理状态，有效降低了船舶的初始投入和营运成本，降低实船运营时耗油率，提高了船舶的经济性。