本实用新型公开了一种用于船舶防护窗的密封结构，属于船舶制造技术领域，旨在提供一种密封效果好的用于船舶防护窗的密封结构，包括框体及均与框体滑动连接的第一窗体和第二窗体，框体的两侧壁上分别设有第一密封圈和第二密封圈，第一密封圈和第二密封圈的端部均向框体中间延伸，第一密封圈和第二密封圈均由弹性材料构成，第一密封圈和第二密封圈均由截面呈弧状的套体及与套体内壁连接且截面呈钝角三角状的弹性条构成，第一密封圈和第二密封圈的套体的端部分别与第一窗体和第二窗体的边框抵触，第一密封圈和第二密封圈的内壁上均设有均匀排布的若干弹性柱。