本发明公开了一种水藻打捞及脱水一体化处理设备及除藻方法，包括打捞船，所述打捞船包括进水机构、过滤机构、脱水机构、除磷机构和收集箱，所述进水机构和过滤机构相连，所述过滤机构分别和脱水机构和除磷机构相连，所述脱水机构和收集箱相连，所述进水机构包括进水管、进水阀、抽水泵和输水管，所述进水阀设置在进水管和输水管的连接处，所述输水管为T字型输水管，包括输送主管和输送分支管，输送主管的一端与进水管相连，另一端与抽水泵相连，所述过滤机构包括储藻筒，所述输送分支管的一端与储藻筒活动相连。本发明不仅可以对水藻进行脱水干燥，还可以对原水进行脱磷处理。