本实用新型提出一种水样采集船，包括：船体、电动机、电动水泵、箱体、计米器，船体具有船舱和与船舱隔离的开放室，电动机、导向轮、计米器均布置在船舱内，电动机的转轴与放线轮之间同轴固定，由放线轮放出的拉绳与计米器、放线轮依次匹配安装后，经由连通船舱与开放室的通孔并固定连接箱体，箱体可进出开放室，箱体的至少一个面板为过滤网板，电动水泵布置在箱体内，电动水泵的出水端连接水管，水管的出水端与远端水样收集器连接。本实用新型可以在水域内穿行，从而对水域内任意位置任意深度的水样进行采集，由于本实用新型采用封闭式设计，不用担心损坏等问题，本实用新型结构相对简单，成本低，便于操作。