本实用新型提出一种全水域任意深度水样采集船，包括：船体、电动机、电动水泵、水管、箱体，船体具有船舱以及与船舱隔离的开放室，电动机固定布置在船舱内，线轮布置在开放室内，电动机转轴穿过船体转动连接线轮，转轴与船体之间活动密封，布置在线轮上的拉绳的活动端穿过开放式出口并固定箱体，箱体至少一个面板为过滤网板，电动机电缆引出船体，电动水泵电缆引出箱体并与远端电源电连接，电动水泵出水管引出箱体并与远端水样收集器连接。本实用新型可以在水域内穿行，从而对水域内任意位置任意深度的水样进行采集，由于本实用新型采用封闭式设计，不用担心损坏等问题，本实用新型结构相对简单，成本低，便于操作。